Quand les Spies débarquent au WOOHP il y a du changement : le bureau de Jerry a été entièrement refait. Maintenant, il a même sa propre assistante :G.L.A.D.I.S. Elle leur annonce qu'un mystérieux voleur a dérobé des gadgets high-tech dans plusieurs laboratoires secrets. Les Spies sont dépêchées sur place pour mener l'enquête. Alors qu'elles essaient de prendre le malfaiteur sur le fait, soudain, leur univers se retrouve sens dessus dessous – littéralement.